وكذا الاهتمام بشؤون المساجد من خلال المتابعة لإصدارات التراخيص اللازمة للبناء بعد رفعها للإدارة العامة وكذا التأكد من سلامة تأدية رسالة المسجد على الشكل الصحيح ومتابعة الحلقات التعليمية في المساجد والمدارس التابعة لها من خلال المناهج والمدرس لينهجوا بمبدأ الوسيطة والاعتدال.

وكذا المتابعة بالصرف للاحتياجات للمساجد اليومية والأساسية بالتنسيق مع الإدارة العامة في الأمور المالية .
ومن اختصاصات المكتب أيضاً متابعة الأمور الموقوفة على المساجد من المحلات التجارية والأراضي الزراعية والاستثمارية وتتمثل مهمة المكتب في المديرية في حفظ الوقف ورعايته واستثماره وتوظيفه للتنمية الشاملة التي تخدم الوقف والمسجد والمحافظة عليه من أي اعتداء من أي معتدي أو غاصب وذلك بالمثول على كل القضايا المتنازع فيها من قبل المحامي المكتب أمام القضاء أو النيابة العامة.
ومن المشاريع المستقبلية التي يطمح إليها المكتب بالمديرية هو تسوير المقابر والترب التي لم تسور بعد ومتابعة ذلك مع الإدارة العامة وكذا إنارة جميع المقابر وذلك خلال المتابعة مع المختصة لاستكمالها.
كما يسعى المكتب إلى فتح المجال أمام أهل الخير والمتصدقين وتذليل الإجراءات إلى كل من أراد بناء مسجد أو ترميمه وتوفير المستلزمات التي تحتاجها المساجد من مصاحف وفرش وإنارة وكتب وغيرها.
وكذا رفع التقارير والخطط إلى الإدارة العامة حسب توجيهات الأخ المدير العام.